Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYT5

KRTAP2-2, Keratin-associated protein 2-2, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CNIH4-205ENST00000465271 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 SLC30A9-201ENST00000264451 6218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC004672.1-201ENST00000513082 2088 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 KCTD6-201ENST00000355076 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 MATN2-208ENST00000520016 3495 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 PTGS2-201ENST00000367468 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 ABCB1-210ENST00000543898 4524 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC107398.3-201ENST00000562284 7000 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 ETV3-202ENST00000368192 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 PLAA-201ENST00000397292 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 SLC39A6-201ENST00000269187 3543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 EHF-201ENST00000257831 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 DST-207ENST00000421834 18030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 KBTBD4-201ENST00000395288 2460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNF252P-208ENST00000592792 2485 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 FRG2-202ENST00000504750 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CORO1C-202ENST00000420959 3921 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 LIMCH1-203ENST00000396595 5740 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 ACKR2-202ENST00000442925 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CCDC191-201ENST00000295878 3976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 FAM47C-201ENST00000358047 3270 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AL354993.1-201ENST00000436286 3280 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 DAZ1-203ENST00000426000 1846 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 GSN-AS1-201ENST00000414544 4763 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CYCS-201ENST00000305786 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 MTPN-201ENST00000393085 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 ANKRD27-201ENST00000306065 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNF252P-201ENST00000426361 5210 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 ALPK1-205ENST00000504176 5203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 IRAK4-201ENST00000431837 4147 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CNDP1-203ENST00000582365 4111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 SNX16-202ENST00000353788 3032 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 MADD-205ENST00000395344 4988 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 PIWIL2-204ENST00000521356 3488 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 ERV3-1-201ENST00000394323 2719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 FAM126A-202ENST00000409923 3130 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 PIEZO2-210ENST00000580640 8334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CEP135-201ENST00000257287 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 BLOC1S6-201ENST00000220531 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AL049775.1-201ENST00000380722 2448 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 SAMD3-203ENST00000437477 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 ABCC11-201ENST00000353782 4463 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 TATDN2-203ENST00000448281 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AZIN1-202ENST00000347770 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 GPRASP2-201ENST00000332262 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 MTMR4-201ENST00000323456 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CLIP1-218ENST00000545889 4633 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CYP4A22-203ENST00000371891 2535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 SERPINB10-201ENST00000238508 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 DEFA6-201ENST00000297436 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 TBX5-201ENST00000310346 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC02449-202ENST00000399866 517 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 SNORA2C-201ENST00000408564 137 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AP000431.1-201ENST00000424219 469 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AL135924.2-201ENST00000427901 361 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms