Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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