Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 PARP14-202ENST00000474629 7915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 C1orf21-201ENST00000235307 10265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 IGHVIII-13-1-201ENST00000517613 291 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 MUC3A-203ENST00000483366 9944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 SPRYD4-201ENST00000338146 10779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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