Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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