Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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PTPN13Q12923 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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PTPN13Q12923 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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