Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD12P35452 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms