Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 DNAI1-201ENST00000242317 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 ASCC1-201ENST00000317126 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SNPHO15079 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
SNPHO15079 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SNPHO15079 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC091304.1-202ENST00000568624 3100 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SNPHO15079 CYFIP2-210ENST00000522463 3477 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SNPHO15079 MR1-208ENST00000614012 7860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC091806.1-201ENST00000452690 3000 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SNPHO15079 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 ZFP42-203ENST00000618147 2338 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 MBTPS2-201ENST00000365779 4457 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 NPIPB4-203ENST00000415645 3606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 MUC1-209ENST00000368396 516 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 AL450124.1-201ENST00000376401 353 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 PHBP1-201ENST00000392260 808 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 RPSAP59-201ENST00000421048 890 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 HMGA1P4-201ENST00000428643 334 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 AC097468.2-201ENST00000429343 553 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 SALL1P1-201ENST00000438101 3837 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 AL133215.1-201ENST00000447344 342 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 AL031736.1-201ENST00000449688 618 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 RN7SL89P-201ENST00000480252 283 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 OR4N1P-201ENST00000554847 949 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 AC103740.1-204ENST00000557994 570 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 CCDC32-203ENST00000558113 576 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 AC142086.3-201ENST00000563896 802 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 AC068014.1-201ENST00000576836 413 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 AC010605.1-201ENST00000597303 797 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 AC068631.1-229ENST00000599314 739 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 MIR6761-201ENST00000617899 72 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 AL109954.1-201ENST00000619495 557 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 MAP4-209ENST00000434267 2772 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 AC016930.1-201ENST00000468766 2205 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 SUPT20H-205ENST00000464744 2625 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 AC104083.1-201ENST00000569449 2615 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 UGT2B4-201ENST00000305107 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 NPIPB9-202ENST00000550983 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 AC004941.1-201ENST00000417506 3120 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SNPHO15079 AC087203.2-201ENST00000526502 1587 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SNPHO15079 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SNPHO15079 ZNF585B-204ENST00000531805 2971 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SNPHO15079 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SNPHO15079 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SNPHO15079 TRIM2-203ENST00000437508 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SNPHO15079 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SNPHO15079 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SNPHO15079 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SNPHO15079 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SNPHO15079 AL022068.1-201ENST00000636202 1875 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SNPHO15079 RNA5SP301-201ENST00000362537 121 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SNPHO15079 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SNPHO15079 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SNPHO15079 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SNPHO15079 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SNPHO15079 SNORA7B-201ENST00000384360 139 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SNPHO15079 COX6A1P3-201ENST00000404167 293 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SNPHO15079 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SNPHO15079 MED15P8-201ENST00000411601 545 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SNPHO15079 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SNPHO15079 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SNPHO15079 OR3B1P-201ENST00000437536 893 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SNPHO15079 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SNPHO15079 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SNPHO15079 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SNPHO15079 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SNPHO15079 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SNPHO15079 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SNPHO15079 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SNPHO15079 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms