Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 ZNF573-202ENST00000357309 2124 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
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