Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms