Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
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SYCP1Q15431 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
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SYCP1Q15431 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
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