Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 LIG3-202ENST00000378526 8400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
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RYR3Q15413 ERBB4-202ENST00000342788 12136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
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RYR3Q15413 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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RYR3Q15413 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
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RYR3Q15413 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
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