Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms