Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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PRPF4BQ13523 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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PRPF4BQ13523 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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PRPF4BQ13523 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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PRPF4BQ13523 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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