Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 XPNPEP3-206ENST00000614001 230 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 ZMYM2-202ENST00000382871 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 KLHL2-209ENST00000514860 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 ESRP1-204ENST00000454170 3482 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 TTLL5-207ENST00000554510 2624 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 GPBP1-203ENST00000424459 4683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 FAM186A-201ENST00000327337 7127 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 OR2V2-203ENST00000641791 4428 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC145138.1-201ENST00000512908 2851 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 IL1RL1-203ENST00000404917 3571 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 PSG9-204ENST00000418820 1748 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 ZNF226-213ENST00000588883 5972 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 RAB3IP-215ENST00000551641 2840 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AQP4-AS1-201ENST00000568797 3119 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 LINC00506-203ENST00000629295 4300 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 RBBP5-201ENST00000264515 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 NFRKB-203ENST00000524794 4351 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 LPAR1-202ENST00000374430 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 C1orf21-201ENST00000235307 10265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC008676.2-202ENST00000509655 1992 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 DAZ2-206ENST00000382440 4119 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC008620.1-201ENST00000468453 592 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 IGKV1D-32-201ENST00000517449 318 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC099314.1-201ENST00000563916 562 ntTSL 4 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC004852.1-201ENST00000605206 154 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 GLUD1P2-202ENST00000630097 606 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC005841.2-201ENST00000637658 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 SLC24A1-212ENST00000546330 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 ADGRG7-201ENST00000273352 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 WDR89-204ENST00000620954 2935 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 NRG3-206ENST00000545131 2713 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 UNC5D-206ENST00000453357 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 TRPS1-212ENST00000640765 9514 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 IL1B-201ENST00000263341 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 PTBP3-204ENST00000374255 3413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 IGSF11-201ENST00000354673 3206 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 CREM-208ENST00000361599 2170 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 UBE2V1-202ENST00000371657 1973 ntTSL 4 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 ZNF577-201ENST00000301399 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 OR2T35-202ENST00000641268 2957 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 PLEKHG4B-204ENST00000637938 12612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 CAP1-206ENST00000372805 2217 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 FOPNL-206ENST00000573968 2039 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 MAP3K9-207ENST00000611979 10497 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 TOGARAM2-201ENST00000379558 12691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC114752.2-201ENST00000424119 404 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.9 ms