Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 CEACAM5-203ENST00000405816 2354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
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MKRN3Q13064 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
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MKRN3Q13064 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
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MKRN3Q13064 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
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MKRN3Q13064 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
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MKRN3Q13064 RN7SL870P-201ENST00000460111 296 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
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MKRN3Q13064 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
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MKRN3Q13064 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
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MKRN3Q13064 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
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MKRN3Q13064 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
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MKRN3Q13064 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
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MKRN3Q13064 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
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MKRN3Q13064 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AL512662.1-201ENST00000624850 2251 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
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MKRN3Q13064 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
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MKRN3Q13064 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
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MKRN3Q13064 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
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MKRN3Q13064 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
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MKRN3Q13064 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 RPL10P18-201ENST00000519384 309 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC8.15□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC8.15□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC8.15□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC8.15□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC8.15□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AL390037.1-201ENST00000610918 431 ntTSL 3 BASIC8.15□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
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