Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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SGCBQ16585 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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SGCBQ16585 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
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