Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms