Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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SP140Q13342 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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SP140Q13342 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SP140Q13342 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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SP140Q13342 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SP140Q13342 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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SP140Q13342 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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SP140Q13342 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SP140Q13342 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SP140Q13342 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SP140Q13342 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SP140Q13342 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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