Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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BPTFQ12830 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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BPTFQ12830 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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