Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms