Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC027801.3-201ENST00000515049 698 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AL136018.1-202ENST00000555300 488 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 P3H2-203ENST00000427335 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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