Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 GOLGA6L5P-203ENST00000559768 578 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 LINC02073-201ENST00000588341 2845 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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