Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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CHAF1BQ13112 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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CHAF1BQ13112 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
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