Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
PTPRCP08575 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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PTPRCP08575 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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PTPRCP08575 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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PTPRCP08575 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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PTPRCP08575 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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PTPRCP08575 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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PTPRCP08575 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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PTPRCP08575 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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