Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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FOXQ1Q9C009 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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FOXQ1Q9C009 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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FOXQ1Q9C009 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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