Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 MBL2-201ENST00000373968 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 ZNF595-204ENST00000609518 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 LINC01095-202ENST00000507726 1715 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 DUBR-202ENST00000466734 2737 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 PTMAP1-205ENST00000455552 325 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 ASCC1-201ENST00000317126 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 PARD3-212ENST00000544292 2475 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 KCNK2-203ENST00000444842 3379 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 AL022100.1-202ENST00000421214 548 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PRPF38BQ5VTL8 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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