Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 TDGF1P3-201ENST00000493351 567 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC079768.1-201ENST00000503181 711 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC034206.1-201ENST00000509372 474 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 TECRP1-201ENST00000513307 445 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 NACA2-201ENST00000521764 777 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC083967.1-201ENST00000522354 515 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC156455.1-201ENST00000538790 851 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC092868.1-201ENST00000557949 802 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 MIR4695-201ENST00000577305 74 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 TTN-AS1-210ENST00000578746 677 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC024619.3-201ENST00000582196 323 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 U47924.1-201ENST00000606539 434 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC243829.2-201ENST00000617914 470 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC129908.1-201ENST00000624553 648 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL353747.4-202ENST00000625787 674 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 TTC38-207ENST00000629918 162 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 LBR-201ENST00000272163 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 GZMA-201ENST00000274306 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 DYNLRB1-202ENST00000357156 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 S100A4-204ENST00000368716 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 KCNAB1-202ENST00000389634 1119 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 OCM-202ENST00000416608 623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 BPI-202ENST00000417318 1082 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RPSAP1-201ENST00000421328 880 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC138207.1-201ENST00000442757 545 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 OR5S1P-201ENST00000453063 951 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RN7SL333P-201ENST00000476398 297 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC009153.1-201ENST00000485799 496 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RN7SL291P-201ENST00000487916 289 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RPL17P37-201ENST00000490729 548 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms