Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NFIXQ14938 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms