Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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CUL4AQ13619 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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CUL4AQ13619 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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