Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA3BQ13214 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms