Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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CHAF1BQ13112 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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CHAF1BQ13112 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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CHAF1BQ13112 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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CHAF1BQ13112 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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