Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 MYT1L-AS1-202ENST00000448106 3230 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 PTPRT-211ENST00000618610 3230 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 ELMO2-202ENST00000352077 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 RGS7-201ENST00000348120 1980 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 FCGR3B-209ENST00000614870 1993 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 MORC1-202ENST00000483760 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 MAPK10-241ENST00000639234 2985 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 YES1-201ENST00000314574 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 LNX1-202ENST00000306888 3757 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 BCO2-203ENST00000438022 2598 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 KLHL32-202ENST00000369261 3698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 ZNF189-202ENST00000339664 3021 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 DHFR2-201ENST00000314636 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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FOXC1Q12948 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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FOXC1Q12948 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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FOXC1Q12948 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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FOXC1Q12948 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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FOXC1Q12948 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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FOXC1Q12948 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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FOXC1Q12948 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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FOXC1Q12948 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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FOXC1Q12948 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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FOXC1Q12948 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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FOXC1Q12948 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 TMEM138-209ENST00000542946 2839 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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FOXC1Q12948 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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FOXC1Q12948 TMEM99-204ENST00000622451 2073 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 EPB41-202ENST00000347529 2676 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 GRIK1-202ENST00000389124 2712 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 ATP1A4-201ENST00000368081 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AL590143.1-201ENST00000405071 138 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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