Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 TRPS1-209ENST00000519674 3116 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 MMACHC-201ENST00000401061 5296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC068535.1-201ENST00000416008 471 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC120036.3-201ENST00000517826 292 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 AF121897.1-201ENST00000411867 3980 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 ZNF670-ZNF695-202ENST00000474541 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 DGKB-205ENST00000406247 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 HNRNPC-201ENST00000336053 3301 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 TMEM2-205ENST00000377066 5217 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 CCDC162P-214ENST00000640755 1958 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 CUBNP1-201ENST00000412710 1790 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 SMIM2-201ENST00000400419 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 RAC1P4-201ENST00000419413 579 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 GCSAM-201ENST00000308910 3336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 TROVE2-205ENST00000367446 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 PTPRT-204ENST00000373190 12559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 DIAPH3-203ENST00000400319 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC087280.2-201ENST00000637205 4822 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 SYT14-202ENST00000367019 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 LRRC37A2-201ENST00000333412 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 GALR1-201ENST00000299727 10044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 TMEM138-209ENST00000542946 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRHP20396 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 SERPINB13-201ENST00000269489 3206 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 MAP2-207ENST00000447185 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 ADAL-202ENST00000422466 3767 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 COLGALT2-203ENST00000367521 4723 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 AL954705.1-201ENST00000435277 559 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms