Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.4 ms