Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms