Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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