Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 SELP-201ENST00000263686 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC018688.1-201ENST00000636528 1754 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 KCNK2-203ENST00000444842 3379 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 CASP10-206ENST00000374650 1126 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AL590143.1-201ENST00000405071 138 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC067817.2-201ENST00000459965 387 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC026458.1-201ENST00000564330 438 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 SLC35A3-201ENST00000370153 5708 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 SLC30A8-205ENST00000519688 5242 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 ARPP21-221ENST00000444190 3182 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 RPL23P10-201ENST00000468780 412 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 MYO1B-201ENST00000304164 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
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