Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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PTPRAP18433 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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