Protein–RNA interactions for Protein: V9GY48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY48 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
V9GY48 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
V9GY48 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
V9GY48 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
V9GY48 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
V9GY48 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
V9GY48 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
V9GY48 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
V9GY48 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
V9GY48 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
V9GY48 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
V9GY48 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
V9GY48 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
V9GY48 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
V9GY48 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
V9GY48 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
V9GY48 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
V9GY48 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
V9GY48 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
V9GY48 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
V9GY48 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
V9GY48 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GY48 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GY48 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GY48 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GY48 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GY48 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GY48 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GY48 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GY48 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GY48 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GY48 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GY48 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GY48 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GY48 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GY48 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GY48 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GY48 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GY48 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GY48 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GY48 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GY48 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GY48 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GY48 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GY48 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GY48 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GY48 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GY48 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GY48 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GY48 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GY48 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GY48 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GY48 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GY48 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GY48 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GY48 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GY48 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GY48 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GY48 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GY48 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GY48 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GY48 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GY48 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GY48 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GY48 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GY48 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GY48 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GY48 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GY48 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GY48 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GY48 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GY48 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GY48 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GY48 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GY48 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GY48 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GY48 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GY48 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GY48 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GY48 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GY48 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GY48 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GY48 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GY48 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GY48 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GY48 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GY48 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GY48 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GY48 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GY48 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GY48 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
V9GY48 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
V9GY48 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
V9GY48 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
V9GY48 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
V9GY48 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
V9GY48 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
V9GY48 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
V9GY48 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
V9GY48 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms