Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MAP3K4Q9Y6R4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
MAP3K4Q9Y6R4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MAP3K4Q9Y6R4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms