Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms