Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y696

CLIC4, Chloride intracellular channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC4Q9Y696 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIC4Q9Y696 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms