Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NRXN3Q9Y4C0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms