Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SH3BP1Q9Y3L3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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