Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms