Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms