Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP8A1Q9Y2Q0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms