Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms