Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGSF9BQ9UPX0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms