Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms